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開放服務(wù)

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寧夏醫(yī)科大學(xué)顱腦疾病實(shí)驗(yàn)室生物信息研究室介紹

發(fā)布日期:2019-09-30    作者:     來源: 顱腦疾病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室    點(diǎn)擊:

生物信息學(xué)是伴隨"人類基因組計(jì)劃"的推進(jìn)而誕生的高通量分子信息分析手段和技術(shù),,為促進(jìn)神經(jīng)生物信息學(xué)方法在日常工作中的應(yīng)用,寧夏醫(yī)科大學(xué)顱腦疾病實(shí)驗(yàn)室生物信息研究室于2019年9月4日成立,。

研究室的主要工作內(nèi)容為:1)神經(jīng)功能性疾病的關(guān)鍵致病和/或保護(hù)因素所致的重要基因組學(xué),、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)與代謝組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘,;2)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)生物學(xué)特征在神經(jīng)功能性疾病中的變化及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì),、蛋白質(zhì)-DNA、蛋白質(zhì)-外源性化學(xué)物質(zhì)相互作用的預(yù)測,;3)臨床既有病案數(shù)據(jù)的科學(xué)意義的凝煉,、基礎(chǔ)研究成果的臨床轉(zhuǎn)化可能性探討;4)基礎(chǔ)研究中統(tǒng)計(jì)學(xué)問題咨詢,。

生物信息學(xué)研究室主要依托精密儀器室,、蛋白電泳室、核酸電泳室,、稱量室等4個(gè)分子生物學(xué)平臺(tái)開展研究,,目前共有各類設(shè)備共計(jì)140余臺(tái),共計(jì)400余萬元,,擁有雙色近紅外成像系統(tǒng)(oddsey,美國Li-cor),、實(shí)時(shí)熒光PCR儀(美國Bio-rad)、PCR擴(kuò)增儀(美國ABI),、凝膠圖像分析系統(tǒng)(美國Bio-rad),、臺(tái)式冷凍離心機(jī)(美國Thermo)、核酸蛋白分析儀(美國Thermo Nanodrop 2000),、紫外-可見分光光度計(jì)等儀器設(shè)備可開展多類基因組學(xué),、蛋白組學(xué)實(shí)驗(yàn)研究。近5年共為200余名教師,、碩士,、博士研究生提供平臺(tái)及技術(shù)服務(wù)。

生物信息學(xué)研究室團(tuán)隊(duì)由國內(nèi)知名院校碩,、博士組成,,成員具備醫(yī)學(xué)、生化與分子生物學(xué),、結(jié)構(gòu)生物學(xué),、流行病學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)等多學(xué)科背景,,具備生物信息學(xué)分析,、計(jì)算機(jī)編程、蛋白質(zhì)復(fù)合體結(jié)構(gòu)解析,、數(shù)據(jù)管理,、大型流行病學(xué)調(diào)查、數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析等技能,。研究室成員共同致力于打通多學(xué)科壁壘,,以“生物信息”為主線,貫穿“神經(jīng)”系統(tǒng)和“神經(jīng)”活動(dòng)全過程中不同層次神經(jīng)生物學(xué)信息的獲取,、分析,、管理。團(tuán)隊(duì)成員已指導(dǎo)4名本科生畢業(yè)設(shè)計(jì),,其中2人獲優(yōu)秀畢業(yè)論文,;輔導(dǎo)學(xué)生完成國家級(jí)及自治區(qū)級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目各1項(xiàng)。

研究室未來的發(fā)展規(guī)劃為:1)結(jié)合實(shí)驗(yàn)室研究方向,,明確以癲癇/島葉功能相關(guān)的神經(jīng)生物信息學(xué)研究為重點(diǎn)研究范圍,;2)基于研究室人員前期工作基礎(chǔ),開展中樞神經(jīng)系統(tǒng)生物大分子相互作用預(yù)測,、重要蛋白結(jié)構(gòu)解析等工作,;3)突出寧夏特色,,開展包括但不限于寧夏特色植物活性物質(zhì)數(shù)據(jù)庫構(gòu)建及其與生物大分子相互作用預(yù)測工作;4)利用既有資源,,促進(jìn)臨床病案數(shù)據(jù)科學(xué)意義的提煉,、輔助全區(qū)重大腦疾病公共衛(wèi)生服務(wù);5)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室成員,,提供實(shí)驗(yàn)過程中數(shù)據(jù)的流行病學(xué)及統(tǒng)計(jì)學(xué)咨詢服務(wù),;6)組建公益性質(zhì)學(xué)術(shù)組織,輻射寧夏其他高校,。